核桃Y2SK2型脱水素基因JrDHN的克隆、表达和单核苷酸多态性分析
采用RT-PCR和RACE技术从‘香玲’核桃(Juglans regiaL.‘Xiangling')叶片中克隆了1个脱水素基因JrDHN(GenBank登录号KC503061.1),其全长1 056bp,具有528 bp的开放阅读框,编码175个氨基酸组成的多肽,具有LEA家族成员的特征多肽序列,属于典型的Y2SK2型脱水素.以核桃18S基因为内参,对‘香玲’核桃JrDHN在4℃胁迫下的表达模式进行了初步的研究,结果表明低温诱导下叶片中JrDHN的表达增加,4℃处理4h后达到最大值;自然越冬条件下,花芽中JrDHN表达量呈先上升后下降的趋势,在12月份表达量最高,推测JrDHN在核桃对低温胁迫响应中发挥重要功能.‘香玲’JrDHN在雌花中表达量高,其次是叶片和树皮,在花芽中最低.单核苷酸多态性分析JrDHN序列中有30个SNPs位点和11个Indels;单倍型分析显示12份核桃材料可分为10个单倍型,单倍型多样性为0.9697.
核桃、脱水素基因、定量RT-PCR、单核苷酸多态性
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S664.1(果树园艺)
科技部科技基础条件平台项目2014-048;农业部种质资源保护与利用项目2014NWB009;山东省农业良种工程项目鲁科农字[2011]086;中俄国际科技合作专项2012DFR30700
2014-09-25(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
1573-1582