牡丹LINE类反转录转座子RT序列的克隆及分析

摘要：

利用LINE简并引物从中原牡丹品种‘洛阳红’中扩增出580 bp左右的目的条带,对其回收、克隆、测序及相关生物信息学软件分析后获得32条LINE类牡丹反转录转座子RT(反转录酶)序列.这些序列长度为547 ～ 593 bp,主要表现为点突变,经Clustal W比对其同源性为25.7％ ～ 94.2％.将其核苷酸序列经聚类后可分为4个家族,其中家族Ⅰ和Ⅲ分别占总序列数的50％和28％.将32条RT序列翻译成氨基酸序列,在第18氨基酸序列处有1个非常保守的的甘氨酸(Gly),在138氨基酸序列处有1个半保守的赖氨酸(Lys)位点.32条序列均发生较多的终止密码子突变和移码突变.与其他物种的系统进化树分析,表明牡丹LINE类反转录转座子RT序列既有一定的保守性,同时也与其他物种间存在一定的同源性.

关键词：牡丹、非LTR类反转录转座子、反转录酶

所属期刊栏目：41

分类号：S685.11(观赏园艺（花卉和观赏树木）)

资助基金：国家自然科学基金项目31070620;洛阳市科技攻关项目1102061A;河南省高校科技创新人才支持计划项目13HASTIT004;河南省重点科技攻关项目132102110029

在线出版日期：2014-03-11（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：157-164