两种SNP分型方法的比较及其在柚品种鉴定中的应用

摘要：

用两种常用的SNP分型方法,等位基因特异性PCR法(Allele-specific PCR,AS-PCR)和高分辨率熔解曲线分析(High resolution melting analysis,HRMA),对16个柚栽培品种和8个柚杂种后代材料进行了7个SNP位点的分型研究.结果表明这两种方法所得的分型结果相同,都将24个样本分成了22种基因型.值得一提的是,样本‘八朔’与‘红八朔’,‘红甘夏’与‘川野夏橙’之间在所测位点无差别,表明其应当是同一来源的无性系变异.‘早熟真龙柚’和‘中熟真龙柚’的分型结果表明它们的基因型不同,看来并非是起源同一基因型的不同芽变品种,也不存在亲子关系.可见,AS-PCR和HRMA均适用于柚类品种的区分和鉴定.AS-PCR法是一种准确、低成本的SNP分型方法,适合普通实验室使用,惟对PCR反应体系要求严格.HRMA分型法具有准确、快速、简便、分析量大的特点,但需要专门的设备,试剂成本也高.

关键词：柚、单核苷酸多态性、等位基因特异性PCR、高分辨率熔解曲线分析、基因分型

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分类号：S666(果树园艺)

资助基金：国家自然科学基金项目30971992;国家重点基础研究发展计划973项目2011CB100600

在线出版日期：2013-08-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：1061-1070