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苹果锚蛋白基因ANK家族生物信息学鉴定分析

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利用生物信息学方法对苹果ANK基因家族成员及分类鉴定,同时对其染色体定位、系统进化关系及芯片表达特性进行了分析.苹果MdANK家族包含351个基因,根据蛋白结构域差异分为16个类别,ANK-M类型最为庞大,有143个ANK蛋白;苹果的17条染色体均有ANK家族基因分布,其中第2条染色体上分布最多,有36个ANK基因.MdANK编码的蛋白在72 ~2 429个氨基酸范围内,等电点在4.30~ 11.13之间.芯片分析发现,在苹果果实成熟时期及砧木接穗互作过程中,多数MdANK基因的表达都有不同程度变化.

苹果、ANK、基因家族、生物信息学

40

S661.1(果树园艺)

国家自然科学基金项目31000307;山东省优秀中青年奖励基金项目BS2010NY004;山东省自然科学基金项目Y2007D60,ZR2009DQ003;潍坊学院博士科研基金项目2012BS15

2013-08-07(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)

共12页

1021-1032

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园艺学报

0513-353X

11-1924/S

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2013,40(6)

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