菊花矮化类病毒的分子检测与序列分析

摘要：

菊花矮化病由菊花矮化类病毒（Chrysanthemum stunt viroid,CSVd）引起。从北京、海南万宁、合肥和哈尔滨共采集了122个野生及商业种植的菊花样品,使用改进的CTAB法提取菊花总RNA后,通过斑点杂交检测CSVd,应用RT-PCR对阳性样品进行克隆、测序。斑点杂交结果表明,在检测的122个样品中有14个样品感染了CSVd,感染率为11.5%;除哈尔滨外的其余3个地区均有CSVd的发生。序列比较分析结果表明,中国的CSVd分离物与韩国和日本分离物的序列最为接近,对其二级结构进行分析发现,与CSVd的参考序列（NC002015）相比,所获得的中国CSVd分离物的序列中虽然有21个碱基发生了突变（大多位于二级结构上的致病区内）,但并未影响其折叠成稳定的拟棒状结构。

关键词：菊花、菊花矮化类病毒、斑点杂交、RT-PCR、序列分析

所属期刊栏目：38

分类号：S682.11(观赏园艺（花卉和观赏树木）)

资助基金：国家自然科学基金项目30970134;30811140157;30771403

在线出版日期：2012-04-21（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：2349-2356