香蕉根系均一化全长cDNA文库的构建和鉴定
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香蕉根系均一化全长cDNA文库的构建和鉴定

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以香蕉幼苗根系为材料,利用DSN(duplex-specific nuclease)均一化技术与SMART(switching mechanismat5′end of RNA transcript)技术相结合,构建香蕉根系均一化全长cDNA文库。经检测,初级文库滴度1.1×106cfu·mL-1,库容5×106个独立克隆,重组率大于95%,插入片段平均长度大于1kb,表明文库质量较好。随机挑取192个克隆进行EST(expressed sequencetags)测序,成功获得179个高质量EST,含5个conting和174个singlet,冗余度仅为2.35%。小规模测序拼接后获得145个unigenes,对unigenes分析结果表明文库的可靠性好。从序列比对结果中挑选3个与其它植物同源的抗逆基因,利用RT-PCR方法进行了干旱、低温及盐胁迫条件下基因表达分析,结果显示这3个基因在不同的逆境下差异表达。

香蕉、根系、均一化、cDNA文库、基因、表达

38

S668.1(果树园艺)

中央级公益性科研院所基本科研业务费专项2009hzs1J026;国家现代农业产业体系项目CARS-32

2012-04-21(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)

1667-1674

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园艺学报

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11-1924/S

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2011,38(9)

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