黄瓜抗白粉病品系cDNA文库构建及EST分析
采用SMART技术构建了高抗白粉病的黄瓜品系JIN5-508的叶片cDNA文库,并对其进行了质量鉴定.结果表明,该文库的重组率为95.3%,库容量为1.02×106pfu·mL-1,平均插入片段为0.5 kb左右,是一个高质量的cDNA文库.利用该文库随机挑选的8 352个克隆从5'端进行单向测序,共获得8 035个有效的ESTs(expressed sequence tags),序列的平均长度为838 bp.进一步的生物信息学分析表明:EST序列拼接出3 467个unigenes,其中包括953个contigs和2 514条singletons,文库冗余度较低,为56.9%;从文库中筛选出了大量的低丰度表达基因,约占unigene总数的72.5%,说明文库的复杂性较高;1 991个unigenes获得分子功能注释,其中与蛋白结合活性和催化活性相关的基因分别达到了41.34%和38.72%;在获得功能注释的unigene中,有部分抗病抗逆相关基因高丰度表达,其中3个unigenes与拟南芥白粉病抗性基因Mlo2、Mlo8和Mlo14高度同源,表明该文库可为进一步研究黄瓜抗白粉病相关的特异基因的克隆及功能验证奠定基础.
黄瓜、白粉病、cDNA文库、EST
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S642.2
江苏省科技支撑计划项目BE2008360;江苏省科技基础设施建设计划项目BM2008008;江苏省高校自然科学研究计划项目09KJB10006
2010-11-19（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
931-938
