甘蓝EST-SSR标记的开发与应用
从NCBI数据库下载62 567条甘蓝相关EST,处理后得到19 611条无冗余的EST,对其进行SSR搜索,共得到1 219条SSR,分布在1 176条EST上,分布密度为1/11.48 kb,包括273种重复基元.在甘蓝EST-SSR中,二核苷酸(353个SSR)和三核苷酸(423个SSR)占主导地位,所占比例分别为28.96%和34.70%;出现最多的重复基元是AG/CT,占总数的25.59%,其次为AAG/CTT(94个,占7.71%).针对1 176条含有SSR的EST设计合成了978对引物.用两份甘蓝自交系对978对引物进行初筛,897对引物有扩增产物,共扩增出1 026条扩增带;128对引物表现出多态性,共有258条多态性带(占总带数的25.15%).利用4对多态性引物,初步构建了中甘11、8398、中甘15、中甘21杂交新品种及其亲本的指纹图谱.以上结果说明从甘蓝相关EST数据库中开发的SSR引物有较好的可用性.
甘蓝、EST-SSR、标记开发、指纹图谱
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S635(蔬菜园艺)
国家'十一五'科技支撑计划项目2008BADBB02;中央级公益性科研院所基本科研业务费专项项目;国家自然科学基金项目30700543;国家'863'计划项目2007AA10Z174;2006AA100108;农业部园艺作物遗传改良重点开放实验室项目
2010-06-02（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共8页
221-228
