萝卜中一种新dsRNA的全长cDNA克隆及序列分析

摘要：

从'一点红'萝卜(Raphanus sativus-root'Yidianhong')叶片中提取dsRNA,应用SPAT方法对各dsRNA条带进行cDNA克隆并测序,除获得先前报道的5条序列(RasR 1～RasR 5)以外,还得到一条新的全长序列,将其定名为RasR 6(EU285027).序列分析结果表明:RasR 6全长为1 778 bp,其正义链编码1个由502个氨基酸组成、分子量约为55.1 kD的蛋白质.该序列与前人报道的双分病毒科5个病毒序列具有相似性,且它们均编码双分病毒科病毒的外壳蛋白(capsid protein,CP).核苷酸序列比对结果显示:RasR 6与同时来源于萝卜的RasR 1和RasR 2的5'UTR序列高度同源,且其3'末端具有poly A结构,而与RasR 3、RasR 4和RasR 5的UTR则没有明显的相似性.因此,推测RasR6与RasR1、RasR 2同属于双分病毒RasV 1(Raphanus sativus virus 1),可能与RasR 2共同编码该病毒的CP或作为RasV 1的卫星RNA存在.

关键词：萝卜、双链RNA、双分病毒科、Raphanus sativus virus 1

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分类号：S631.1(蔬菜园艺)

资助基金：国家自然科学基金30671361;科技部国际科技合作项目2004DFA05000

在线出版日期：2008-11-03（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：1209-1214