番茄S-腺苷蛋氨酸脱羧酶基因SlSAMDC1的克隆与序列分析

摘要：

以蔓陀罗S-腺苷蛋氨酸脱羧酶全长cDNA序列为信息探针,筛选NCBI番茄EST数据库,依据同源EST信息,经人工拼接、RT-PCR及RACE技术验证,获得了1个新的SAMDC基因家族成员,命名为SlSAMDC1(GenBank登录号:EF550528),并利用染色体步移技术克隆了879 bp的上游调控区域.SlSAMDC1 cDNA序列全长1 847 bp,5'-UTR和3'-UTR分别长523和241 bp;存在3个ORF(微型uORF、小型uORF和主ORF),主ORF编码360个氨基酸的SAMDC酶原;SlSAMDC1基因组序列全长3 648 bp,有3个内含子,均位于5'-UTR,所有内含子的剪切位点均符合真核生物"GT-AG"规则.SlSAMDC1基因与其它植物来源SAMDC基因同源性较高,与人、大肠杆菌以及酵母的同源性较低.表达谱分析发现,SlSAM-DC1基因在番茄根、茎、叶、花蕾、果实等器官中均表达,果实中的表达量相对较高.生物信息学分析表明,SlSMDC1基因的上游调控序列存在多个顺式作用元件,如W-box、TATA-box、CAAT-box等.

关键词：番茄、多胺、S-腺苷蛋氨酸脱羧酶、基因克隆

所属期刊栏目：35

分类号：S641.2

资助基金：国家自然科学基金30571274;30771474;农业部重点实验室基金

在线出版日期：2008-11-03（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：1137-1146