利用cDNA-AFLP技术研究苹果柱型与非柱型cDNA的差异表达

摘要：

以苹果(Malus×domestica Borkh.)柱型品种舞姿、非柱型品种富士及其杂交F1群体中柱型、非柱型单株为研究试材,应用cDNA-AFLP (cDNA-amplified fragment length polymorphism)技术,研究柱型与非柱型苹果cDNA的差异表达,探讨了苹果柱型基因Co表达的分子机制.通过64对引物组合的cDNA-AFLP分析获得了1 630条在柱型与非柱型苹果中差异表达的片段.经过BSA(bulked segregant analysis)分析和反向Northern杂交鉴定,获得了11个差异表达的cDNA片段,并进行了克隆、测序和序列同源性检索分析.有5个片段在GenBank数据库中发现同源序列,其余的6个功能未知.核酸和氨基酸比对分析中同源性最高的是片段A7和A16.A7的核苷酸序列同源于红叶石楠Photinia fraseri 26S核糖体RNA(97%)、蛋白同源于玉米的细胞色素P450单加氧酶 (91%),A16的核苷酸(85%)及蛋白(93%)同源于直果草属Triphysaria versicolor的α-expansin 2基因.对A7、A16两个候选基因片段再进行正向Northern杂交验证,在富士中表达最强,在非柱型后代、柱型后代及舞姿中表达依次减弱.由此推断,由细胞色素P450单加氧酶基因所调控的赤霉素GAS变化影响了苹果柱型性状的表达.

关键词：苹果、柱型苹果、柱型基因、差异表达分析、cDNA-AFLP

所属期刊栏目：34

分类号：S661.1(果树园艺)

资助基金：国家自然科学基金30671445

在线出版日期：2007-05-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：283-288