白菜EST-SSR信息分析与标记的建立

摘要：

数量迅速增加的EST为开发新的SSR标记提供了宝贵的资源.本研究对4 584条白菜EST进行了搜索,共检索出474个SSR,检出率为10.3%,包括40种重复基元.其中二核苷酸和三核苷酸重复单元的EST-SSR占主导地位,二者出现的频率基本相近,占总SSR的近83%;其它重复类型所占比例均不足5%.GA和GAA是二、三核苷酸中的优势重复类型,分别占二、三核苷酸重复类型的71.5%和37.5%.设计了15对EST-SSR引物,在合适的PCR反应体系下,以构建EST的白菜自交系A的DNA为模板,对设计的EST-SSR引物进行筛选,发现15对EST-SSR引物都能扩增出产物.进一步用这些可扩增的引物对28个白菜品种进行PCR扩增,发现7对引物显示多态性,占引物总数的46.7%.此结果表明,根据EST建立EST-SSR标记是一条简便而又有效的途径.

关键词：白菜、EST、SSR信息、标记

所属期刊栏目：33

分类号：S634.3(蔬菜园艺)

资助基金：韩国科技厅资助项目98-0402-0601-5

在线出版日期：2006-07-31（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：549-554