利用提升小波的蛋白质相互作用特征提取

摘要：

利用提升小波从蛋白质序列中提取出它们相互作用的频谱特征,经支持向量机训练学习后,用于预测蛋白质间的相互作用.模拟计算结果表明,在阳性数据和阴性数据平衡的前提下,利用提升小波获取的低维蛋白质相互作用特征向量可以得到较高预测精度.进一步阐述了不同物种的蛋白质相互作用网络有着不同特征,为了得到更准确的预测结果,需要利用不同的方法提取蛋白质相互作用的特征.

关键词：提升小波、相互作用特征、数据平衡、蛋白质相互作用

所属期刊栏目：25

分类号：O242.1(计算数学)

资助基金：科技部重大科技专项资助项目2009ZX09103-686;国家自然科学基金资助项目30971480;上海大学研究生创新基金资助项目SHUCX101072

在线出版日期：2012-04-21（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：235-244