大豆根系应答重金属Cd胁迫的转录组分析

摘要：

重金属镉(Cd)作为一种非生命活动所需的常见污染物,在土壤中以低浓度存在时,便可以对生物体产生极强的毒性,影响农作物的生长发育.为了解大豆对重金属Cd胁迫应答的分子机制,把发芽7d的大豆苗在75 μmol·L-1Cd浓度中处理0、4、8、12和48 h,然后取根进行转录组表达分析.共得到2670个表达差异基因,其中4、8、12和48 h处理组中分别有244、1545、442和1401个基因显示了表达差异.这些基因通过GO分类,可分为56类;采用COG数据库进行比对,根据其功能大致可分为25类.KEGG通路富集分析表明,差异表达基因主要富集在苯丙氨酸代谢、泛醌和其他萜类醌生物合成,以及半胱氨酸和甲硫氨酸代谢等通路中.发现3个异黄酮2'-羟化酶基因、2个异黄酮还原酶基因和1个查尔酮合成酶基因在Cd胁迫下均表达上调.RT-PCR检测4个差异表达基因的表达模式与RNA-Seq分析结果一致,证实了RNA-Seq结果的可靠性.

关键词：大豆、重金属镉、转录组

所属期刊栏目：28

分类号：S51;TP3

资助基金：国家自然科学基金项目31370526资助 This work was supported by the National Natural Science Foundation of China 31370526

在线出版日期：2017-07-26（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：1633-1641