东海原甲藻细胞色素b基因实时荧光定量PCR检测体系优化

摘要：

为定量检测现场样品中东海原甲藻的细胞色素b(cytochrome b,Cytb)基因,本研究设计了该基因的特异性引物,并对现场样品反转录反应体系中加入的模板数量和定量PCR反应条件进行了优化.结果表明:设计的引物具有较好的特异性,可有效区分不同的藻类；针对现场样品,在20μL的反转录体系中,适宜加入的RNA模板的量为50 ～ 200 ng；PCR模板稀释10倍或向定量PCR反应体系中加入终浓度为0.2μg·μL-1的牛血清蛋白(BSA)均能有效降低现场样品中抑制物的抑制作用,减小干扰.该方法的建立对从分子水平探讨东海原甲藻暴发和消亡的内在机制具有重要意义.

关键词：东海原甲藻、定量PCR、细胞色素b基因、内参基因

所属期刊栏目：24

分类号：Q178.1;Q7(水生生物学)

资助基金：国家重点基础研究发展计划项目2011CB403602;海洋公益性行业科研专项201105014-03,201205031-03

在线出版日期：2013-04-15（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：541-548