苏丹红Ⅱ与肌红蛋白相互作用的分子模拟与实验

摘要：

用荧光光谱法研究了苏丹红Ⅱ与肌红蛋白(Mb)之间的相互作用. 实验结果表明,二者结合位点数近似为1,结合常数K=3.84×107 L/mol,有很强的相互作用. 用分子柔性对接技术模拟确定了它们之间的作用位点、作用力类型及相互作用能. 理论计算的结果表明,苏丹红Ⅱ和Mb相互作用的势能为-9 419.9 kJ/mol,静电能为-7 468.8 kJ/mol,范德华能为-1 951.0 kJ/mol. 苏丹红Ⅱ与Mb中His64残基形成氢键,苏丹红Ⅱ也能与疏水氨基酸残基,如能产生内源荧光的Phe33、Phe43、Phe106和Phe138等发生作用,这与苏丹红Ⅱ能使Mb荧光猝灭的实验结果一致.

关键词：苏丹红Ⅱ、肌红蛋白、相互作用、分子模拟

所属期刊栏目：26

分类号：O641(物理化学（理论化学）、化学物理学)

资助基金：上海市科委重大科技攻关项目07dz19508;江苏高校自然科学基金07KJD150098;江苏省科技厅自然科学基金BK2008372

在线出版日期：2010-01-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：1332-1335