缺血性脑卒中凋亡相关lncRNA-mRNA网络构建及核心基因预测

摘要：

目的 探索与缺血性脑卒中(IS)凋亡相关的长链非编码RNA(lncRNA)-mRNA网络并预测核心基因.方法 选取 2016 年 1 月至 2017 年 6 月广西中医药大学第一附属医院(以下简称"我院")收治的 10 例IS患者和同期我院社区卫生体检中心10名健康对照者作为研究对象.对微阵列表达谱进行差异分析,使用加权基因共表达网络分析筛选目标模块内的基因,并与凋亡基因取交集.运用STRING网站和Cytoscape软件筛选前 10位差异mRNAs(DEMs),同时与差异lncRNAs(DELs)构建lncRNA-mRNA共表达网络,最后筛选核心基因.结果 获得 3 930个DEMs,模块基因与凋亡基因取交集后得到了 553个与凋亡相关的IS基因.构建的lncRNA-mRNA共表达网络包含 9 个DEMs、277 个DELs,最终筛选出 7 个核心基因G015366、G068382、PIK3CB、BPTF、NR3C1、Akt2和INS.结论 G015366、G068382、PIK3CB、BPTF、NR3C1、Akt2和INS与IS的发生发展相关,可能成为IS诊断标志物.

关键词：缺血性脑卒中、凋亡、mRNA、长链非编码RNA

所属期刊栏目：20

分类号：R743(神经病学与精神病学)

资助基金：国家自然科学基金;国家自然科学基金;广西壮族自治区自然科学基金

在线出版日期：2023-08-25（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：4-9