10.20047/j.issn1673-7210.2023.13.03
基于生物信息学分析miR-143调控TLR2信号通路对溃疡性结肠炎的影响
目的 基于生物信息学分析miR-143调控Toll样受体2(TLR2)信号通路对溃疡性结肠炎(UC)的影响.方法 在GEO数据库中下载GSE75214、GSE53306、GSE48958基因数据集及miRNA数据集GSE68306进行分析.将符合标准的差异miRNA用miRDB软件预测靶基因并与筛选的差异基因映射,挑选出UC中关键miRNA进行实验.按随机数字表法将20只小鼠分为正常组及UC组,每组10只.用葡聚糖硫酸钠进行造模,苏木精-伊红染色法观察病理变化,ELISA检测肿瘤坏死因子-α(TNF-α)含量,Western blot检测结肠TLR2、白细胞介素-1β(IL-1 β)蛋白含量,实时荧光定量PCR检测结肠组织miR-143、核转录因子-κB(NF-κB)、髓样分化因子(MyD88)含量.结果 通过分析发现,共85个差异基因(包括34个下调及51个上调)及19个差异miRNA(5个DEMs高表达,14个DEMs低表达),其中miR-143为关键miRNA.实验显示,与正常组比较,UC组血清中TNF-α含量显著升高,结肠组织miR-143表达显著降低(P＜0.05),TLR2、IL-1β蛋白表达明显升高,NF-κ B、MyD88 mRNA含量升高(P＜0.05).结论 miR-143为UC的重要miRNA,其可能通过调控TLR2通路影响UC发生发展.
溃疡性结肠炎、生物信息学分析、GEO数据库、miR-143、TLR2通路
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R574(消化系及腹部疾病)
国家自然科学基金;江西省自然科学基金青年基金项目;江西省中医药中青年骨干人才培养计划
2023-07-04（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共5页
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