应用Discovery Studio软件预测烟酸姜黄素酯抗动脉粥样硬化的作用靶点

摘要：

目的 运用计算机虚拟筛选技术预测烟酸姜黄素酯抗动脉粥样硬化作用的靶标蛋白.方法 查阅与动脉粥样硬化相关靶标的文献,筛选出60余种与动脉粥样硬化相关的蛋白(分子对接的受体),再对蛋白质晶体结构数据库PDB中的目标蛋白的三维结构活性部位进行分析,采用北京创腾科技有限公司的Discovery Studio分子模拟软件包(版本3.0)中的LibDock模块将烟酸姜黄素酯(配体)与受体蛋白进行分子对接.结果 以对接得出的配体在受体结合位点处的结合形式(poses≥80)和对接吻合度参数(LibDockscore≥100)作为阈值,筛选出CRP、MMP13、ACAT、CETP等11种受体蛋白与烟酸姜黄素酯存在较强的相互作用.结论 该研究结果可预测烟酸姜黄素酯抗动脉粥样硬化的可能作用靶点,对该药的抗动脉粥样硬化药效学研究有一定的指导意义.

关键词：烟酸姜黄素酯、标靶蛋白、分子对接

所属期刊栏目：10

分类号：R541.4(心脏、血管（循环系）疾病)

资助基金：国家自然科学基金资助项目编号81173047;湖南省科学技术课题编号12JJ5068

在线出版日期：2013-08-06（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：16-18,21