狼疮肾炎肾小球中细胞焦亡的生物信息学分析及验证

摘要：

目的 利用生物信息学分析狼疮肾炎(lupus nephritis,LN)与正常对照(NC)肾活检组织肾小球的差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)及细胞焦亡相关基因、免疫细胞浸润情况,为LN发病机制的认识、药物开发等提供新的思路.方法 分析转录组数据集GSE32591筛选出LN和NC组的DEGs并与细胞焦亡相关基因取交集得到细胞焦亡相关DEGs,进行GO、KEGG功能富集、核心基因识别及验证等,明确细胞焦亡相关DEGs主要参与的信号通路,并利用CIBERSORT分析22种免疫细胞浸润情况明确LN的免疫状态.结果 筛选出12个细胞焦亡相关DEGs,主要位于细胞膜和炎性小体,参与细胞因子分泌、细胞因子产生的正调控、MyD88依赖性Toll样受体信号通路等.免疫浸润分析提示初始B细胞(P=0.043)、单核细胞(P=0.025)LN表达升高,而记忆B细胞(P=0.002)、静息CD4+T记忆细胞(P=0.011)、滤泡辅助T细胞(P=0.007)和静息NK细胞(P=0.046)LN表达降低.发现前3位Hub基因CASP1、TLR2和MYD88表达在LN肾组织中明显升高,并与LN肾小球中记忆B细胞、静息CD4+T记忆细胞和静息NK细胞呈负相关,与单核细胞呈正相关.结论 CASP1、TLR2和MYD88可能通过免疫细胞浸润影响LN的疾病进展,可能是预测肾小球细胞浸润的重要生物学标志物,为LN治疗提供新的思路.

关键词：狼疮肾炎、细胞焦亡、免疫细胞浸润、生物信息学分析

所属期刊栏目：52

分类号：R593.24(全身性疾病)

资助基金：国家自然科学基金;广东省基础与应用基础研究基金资助项目

在线出版日期：2023-06-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：62-67