舌鳞状细胞癌关键基因的筛选及其潜在治疗药物的预测

摘要：

目的 通过生物信息学方法筛选舌鳞状细胞癌的关键基因,并预测其潜在的治疗药物.方法 从GEO数据库中下载GSE34105和GSE13601数据集,并利用limma包筛选DEGs.DAVID数据库对DEGs进行GO及KEGG富集分析.STRING数据库构建PPI网络,并在Cytoscape中进行可视化."CytoHubba"筛选Hub基因,并利用TCGA数据库、HPA数据库及RT-qPCR进行验证.最后,在Cellminer数据库中筛选Hub基因潜在的治疗药物.结果 共筛选出192个DEGs,其中上调基因84个,下调基因108个.GO富集分析显示,DEGs主要涉免疫反应、细胞外基质分解等生物学过程;KEGG富集分析显示,DEGs主要富集在EMC-受体相互作用信号通路.筛选出IFIT3、OAS2作为Hub基因.预测出布加替尼、艾沙佐米柠檬酸盐及硼替佐米等19种可能靶向作用于舌鳞状细胞癌的药物.结论 通过生物信息学方法筛选出两个Hub基因,并预测其潜在的治疗药物,为研究舌鳞状细胞癌的分子机制及开发治疗药物提供理论基础.

关键词：舌鳞状细胞癌、生物学标志物、关键基因、分子对接

所属期刊栏目：52

分类号：R793.8(外国民族医学)

资助基金：国家自然科学基金;广西壮族自治区研究生教育创新计划项目

在线出版日期：2023-04-14（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：32-38