成人重症哮喘诱导痰差异表达基因生物信息学分析
万方数据知识服务平台
应用市场
我的应用
会员HOT
万方期刊
×

点击收藏,不怕下次找不到~

@万方数据
会员HOT

期刊专题

10.11969/j.issn.1673-548X.2021.11.013

成人重症哮喘诱导痰差异表达基因生物信息学分析

引用
目的 通过生物信息学技术分析与成人重症哮喘发病可能相关的重要信号通路并筛选出关键基因,以期为重症哮喘的精确诊断及早期干预提供新的理论依据.方法 采用生物信息学方法对重症哮喘患者诱导痰差异表达基因(DEGs)进行筛选和分析.从美国国立生物中心的基因表达汇总(GEO)数据库(https:∥www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/)筛选重症哮喘诱导痰样本(GSE137268)数据集,GEO2R工具获取DEGs,R语言ClusterProfiler包用于富集分析,后使用STRING数据库和Cytoscape软件构建蛋白互作网络并用其筛选出关键基因.结果 获得GSE137268数据集,包含33例重症哮喘诱导痰样本(嗜酸性粒细胞哮喘13例,非嗜酸性哮喘20例)和15例正常对照诱导痰样本.共检测到22185个基因,差异表达101个(矫正后P<0.05及|log2(差异倍数)|≥0.58),其中70个表达上调,31个表达下调;重症哮喘与正常对照之间的DEGs被富集在42个不同的基因本体(GO)子集中,包括HIF-1通路、果糖与甘露糖代谢、PHC2与造血细胞系统等.5个关键基因为JARID、HIST2H2AC、HIST2H2AA3、HIST2H2BE、PHC2.结论 重症哮喘的发生、发展主要与HIF-1通路、果糖与甘露糖代谢、PHC2与造血细胞系统等关键通路及JARID、HIST2H2AC、HIST2H2AA3、HIST2H2BE、PHC2等关键基因密切相关.

支气管哮喘;差异表达基因;生物信息学;GEO数据库;诱导痰

50

R562.25(呼吸系及胸部疾病)

国家自然科学基金;吴孟超医学科技基金

2021-12-14(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)

共6页

50-54,59

相关文献
评论
暂无封面信息
查看本期封面目录

医学研究杂志

1673-548X

11-5453/R

50

2021,50(11)

相关作者
相关机构

专业内容知识聚合服务平台

国家重点研发计划“现代服务业共性关键技术研发及应用示范”重点专项“4.8专业内容知识聚合服务技术研发与创新服务示范”

国家重点研发计划资助 课题编号:2019YFB1406304
National Key R&D Program of China Grant No. 2019YFB1406304

©天津万方数据有限公司 津ICP备20003920号-1

信息网络传播视听节目许可证 许可证号:0108284

网络出版服务许可证:(总)网出证(京)字096号

违法和不良信息举报电话:4000115888    举报邮箱:problem@wanfangdata.com.cn

举报专区:https://www.12377.cn/

客服邮箱:op@wanfangdata.com.cn