基于网络药理学和分子对接探讨二氢杨梅素对线粒体自噬的作用机制

摘要：

目的 利用网络药理学和分子对接方法探讨二氢杨梅素对线粒体自噬的作用机制.方法 使用Swiss Target Prediction数据库预测二氢杨梅素的相关靶点;通过GeneCards数据库和NCBI数据库收集线粒体自噬的相关靶点;利用String数据库构建PPI网络,通过R 4.1.3软件进行GO功能和KEGG通路富集分析,使用Cytoscape 3.7.2软件构建"化合物-靶点-信号通路"网络图;运用PyMOL 2.4.0软件和Auto Dock Tools 1.5.6、Autodock Vina软件进行分子对接.结果 最终得到二氢杨梅素的作用靶点70个,二氢杨梅素与线粒体自噬共有靶点15个;二氢杨梅素与线粒体自噬主要涉及916个生物过程包括对氧化应激、金属离子的反应等,主要富集的信号通路包括癌症蛋白聚糖、癌症、MAPK等40条;"化合物-靶点-通路"网络图显示,二氢杨梅素与线粒体自噬与多个靶点、多个通路具有相互作用;分子对接中二氢杨梅素均能同15个靶点进行有效的结合,其中与FGFR1结合效果最佳,与PPARG的结合效果次之.结论 二氢杨梅素可通过HIF1A、KDR、APP等多个靶点调控癌症蛋白聚糖、癌症、MAPK等多个信号通路参与线粒体自噬.

关键词：网络药理学、分子对接、二氢杨梅素、线粒体自噬

所属期刊栏目：36

分类号：R996(毒物学（毒理学）)

资助基金：湖北省教育厅科学技术研究项目;恩施州科技计划项目

在线出版日期：2023-11-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：10-15