基于单细胞转录组测序数据识别糖尿病肾病发生发展的关键细胞

摘要：

目的 通过单细胞转录组学与大样本表型数据分析糖尿病肾病(DKD)患者肾组织中细胞数量变化以及肾小球组织中相关细胞表型变化,分析在DKD疾病发生发展中起关键性作用的细胞与重要生物学功能.方法 通过GEO数据库选取单细胞数据集GSE131882,使用FindClusters功能对细胞进行聚类,并使用marker基因对得到的细胞群体进行细胞类型鉴定.选取GEO数据库中GSE96804作为表型数据,使用R4.2.0版本中Scissor包识别DKD发病正相关的细胞亚群,筛选关键细胞后绘制差异基因表达火山图,随后对DKD发生发展过程中关键细胞的基因表达进行GSEA富集,并将结果可视化后进行分析.结果 结合单细胞类型鉴定与Scissor结果得出,DKD患者巨噬细胞和间充质细胞、肾β-闰细胞、肾毛细血管内皮细胞、成纤维细胞4种间质细胞Scissor+细胞比例明显高于Scissor-细胞,且细胞数量变化较大;关键细胞通过GSEA分析得出,差异基因主要富集在Toll样受体信号通路、氧化磷酸化信号通路、黏着斑信号通路、ECM受体相互作用信号通路等.结论 肾小球中间充质细胞、肾β-闰细胞、肾毛细血管内皮细胞、成纤维细胞4种间质细胞以及巨噬细胞可能是导致DKD发生发展的关键原因,炎症、能量代谢等功能可能是影响DKD的重要功能.

关键词：糖尿病肾病、单细胞转录组测序、间质细胞、巨噬细胞

所属期刊栏目：36

分类号：R587.1(内分泌腺疾病及代谢病)

资助基金：国家自然科学基金;国家自然科学基金

在线出版日期：2023-11-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：1-9