胰岛素分泌细胞诱导过程中miRNA-mRNA调控网络的生物信息学分析

摘要：

目的 探讨人胚胎干细胞(hESCs)向胰岛素分泌细胞(IPCs)诱导分化过程中基因表达的差异,并构建miRNA-mRNA调控网络.方法 选择GEO数据库内的GSE42094数据集作为研究对象,应用GEO2R分析差异表达基因,对其进行GO功能和KEGG路径以及蛋白互作网络分析,选用miRTarBase数据库预测其靶miRNA,对miRNA-mRNA调控网络进行可视化,并采用文献数据验证.结果 共得到差异表达基因188个,选取诱导后显著下调基因共21个,分析发现POU5F1、DNMT3B和NANOG 3个基因集中在"基因表达调控",且下调基因在"胞核内"比较集中;通过查找靶miRNA,发现miR-335-5p能够调控POU5F1、DNMT3B、NANOG、FAM124B和LECT1 5个基因的表达;验证发现有24个miRNA能够被文献数据验证.结论 基于显著下调基因构建的miRNA-mRNA调控网络参与干细胞诱导分化进程并发挥重要作用.

关键词：微小RNA、胚胎干细胞、胰岛素分泌细胞

所属期刊栏目：36

分类号：R342.2(人体生物化学、分子生物学)

资助基金：辽宁省教育厅科学研究经费面上项目LJKZ1374

在线出版日期：2023-11-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：8-14