结核分枝杆菌TB10.4蛋白的生物信息学分析

摘要：

目的 预测分析结核分枝杆菌Rv0288基因的编码蛋白TB10.4的结构和功能.方法 采用生物信息学软件ORF Finder、ExPASy、PSORT、SOSUI、TMHMM、SOPMA等预测分析结核分枝杆菌TB10.4蛋白的结构和功能.结果 TB10.4蛋白由96个氨基酸组成,分子式为C448H677N125O143S9,原子总数1402,编码基因全长291 bp,等电点4.58,不稳定性50.36,为不稳定性蛋白.ProtScale软件预测TB10.4蛋白的脂肪族氨基酸指数为59.38,平均疏水性-0.266.SOSUI和Signal IP软件预测该蛋白无信号肽无跨膜区.TMHMM、NerNGlyc、NetPhos软件预测TB10.4蛋白为可溶性蛋白,有8个磷酸化位点,无糖基化位点.TB10.4蛋白的二级结构以α-螺旋(86.46％)为主,亚细胞定位于细胞质.IEDB软件预测该蛋白有3个B细胞抗原表位;SYFPEITHI、RANKPEP、NetMHC 软件预测该蛋白有多个 CTL 表位和 Th 表位.STRING 预测 TB10.4 和 esxS、esxB、esxH、esxG、PPE4、PPE 18、PE5等蛋白有相互作用,参与多种胞浆蛋白,其二级结构生物学过程.结论 TB10.4蛋白为不稳定疏水性以α-螺旋结构为主,含有多个T、B细胞抗原位点,能够磷酸化并与多种蛋白相互作用,可作为抗结核疫苗的候选蛋白.

关键词：结核分枝杆菌、ESAT-6蛋白、TB10.4蛋白、生物信息学分析

所属期刊栏目：36

分类号：R378.91+1(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：国家自然科学基金;国家自然科学基金;石河子大学科研计划项目

在线出版日期：2023-11-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：1-7