慢性阻塞性肺疾病与骨质疏松症的生物信息学分析

摘要：

目的 利用生物信息学分析慢性阻塞性肺疾病(COPD)与骨质疏松症(OP)的关系.方法 在Genecards、OMIM、DRUGBANK等数据库查找出COPD和OP的疾病基因靶点,将所获得靶点分别进行汇总、筛选、去重后分别得到两组疾病的最终基因靶点.将两组疾病的最终基因靶点取交集,将共同基因靶点导入STRING数据库构建蛋白互作(PPI)网络图,下载tsv格式的PPI网络,导入Cytoscape3.9.1 软件,通过插件cytoHubba,筛选出Degree前 20 位的目标靶基因.利用DAVID数据库对两种疾病的共同靶基因进行GO和KEGG富集分析.结果 筛选出COPD相关基因 393 个、OP相关基因 1389 个,取交集后获得共同靶点基因 172 个,根据PPI网络图可知,STAT3、IL6、AKT1、CTNNB1、IL10、MAPK1、IL17、TNF等为COPD与OP的共同关键靶基因,GO富集显示其主要与雌激素代谢、炎症反应、细胞对缺氧的反应、免疫反应、增龄等相关,KEGG信号通路包括JAK-STAT信号通路、HIF-1 信号通路、IL-17 信号通路等.结论 通过COPD与OP的共同关键基因和涉及的信号通路,为了解两种疾病相关性及为后续相关研究提供了一定的理论基础.

关键词：生物信息学、骨质疏松症、慢性阻塞性肺疾病、靶基因

所属期刊栏目：36

分类号：R259(中医内科)

资助基金：湖北省自然科学基金;湖北省重点实验室开放基金;黄冈市科技创新专项

在线出版日期：2023-09-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：1-6