基于网络药理学和分子对接技术探讨淫羊藿苷治疗骨质疏松症的作用机制

摘要：

目的 基于网络药理学和分子对接技术探讨淫羊藿苷治疗骨质疏松症的作用机制.方法 通过中药系统药理学数据库及分析平台(TCMSP)、毒理基因组学数据库(CTD)、GeneCards数据库、STITCH数据库筛选淫羊藿苷的相关靶点;使用OMIM数据库、GeneCards数据库、DrugBank数据库获得骨质疏松症的相关靶点,与淫羊藿苷相关靶点进行映射,取交集得到淫羊藿苷治疗骨质疏松症的潜在作用靶点;通过STRING数据库构建潜在作用靶点的蛋白质相互作用(PPI)网络,并利用Cytoscape软件进行拓扑分析筛选核心靶点;采用Cytoscape 3.8.2软件构建"淫羊藿苷-潜在靶点"网络;利用R软件对潜在靶点进行基因本体(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析;使用AutoDock软件对有效成分和核心靶点进行分子对接.结果 通过TCMSP、CTD、GeneCards数据库、STITCH数据库筛检索获得淫羊藿苷活相关靶点148个.通过OMIM数据库、GeneCards数据库、DrugBank数据库获得骨质疏松症的相关靶点898个,淫羊藿苷治疗骨质疏松症的潜在作用靶点50个.PPI网络拓扑分析筛使用MCC算法找到了目标蛋白的前10个Hub基因,分别是STAT3、MAPK3、JUN、FOS、MAPK1、ESR1、SRC、IL-6、TGFβ1、AKT1.GO功能富集分析得到1224个生物过程、29个细胞组分及64个分子功能;KEGG信号通路富集分析获得152条信号通路;分子对接结果显示,淫羊藿苷与关键靶点IL-6、AKT1、JUN、MAPK3、SRC、STAT3、TGFβ1的结合能均<-5 kcal/mol,具有良好的结合力.结论 淫羊藿苷可通过多靶点、多途径调节骨代谢稳态平衡,发挥抗骨质疏松作用.

关键词：淫羊藿苷、骨质疏松症、网络药理学、分子对接

所属期刊栏目：36

分类号：R681(骨科学（运动系疾病、矫形外科学）)

在线出版日期：2023-04-06（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：29-36