10.3969/j.issn.1006-1959.2023.03.015
基于GEO差异基因分析及网络药理学探究真人养脏汤治疗活动性溃疡性结肠炎的分子机制研究
目的 通过GEO差异基因分析及网络药理学探究真人养脏汤治疗活动性溃疡性结肠炎的分子机制.方法 从GEO数据库检索溃疡性结肠炎,选择成年人活动期样本,并下载相关样本文件,再以R语言进行差异基因分析,获得相关靶点;从TCMSP数据库检索真人养脏汤各组成有效化合物成份及其对应的相关靶点,提取差异基因与相关药物靶点的交集,在STRING数据库中查询其蛋白互相作用网络(PPI),使用Cytoscape软件构建"药物-成分-靶点"调控网络并提取核心靶点,再利用R语言对其进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析.结果 筛得差异基因1097个,查得真人养脏汤中有效成分141个,对应靶点258个;从其中36个交集靶点中筛选出PPI核心靶点10个,关键靶点涉及白介素6(IL-6)、肿瘤坏死因子(TNF)、基质金属蛋白酶9(MMP9),基因显著富集于对脂多糖反应、受体配体活动、信号受体激活因子活性等分子功能.通路主要富集于肿瘤坏死因子(TNF)、白介素17(IL-17)、核转录因子κB(NF-κB)信号通路.结论 真人养脏汤治疗UC具有多靶点、多通路等特点,尤其在炎性反应通路及免疫相关通路发挥重要作用.
溃疡性结肠炎、GEO差异基因分析、网络药理、真人养脏汤
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R285.5;R574.62(中药学)
2023-04-26(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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