基于生物信息学分析筛选银屑病的关键基因

摘要：

目的 利用生物信息学方法筛选银屑病的关健基因及所在信号通路,探讨其发病机制.方法 从开源性基因表达综合数据库(NCBI-GEO)中获取3个银屑病皮损和非皮损活检样本的相关数据集.利用R语言GEO Query和Limma包筛选3个数据集中差异基因(DEGs),通过R语言clusterProfiler包对DEGs进行生物学过程、信号通路分析,最后通过Cytoscape3.6.0软件做出蛋白-蛋白互作网络分析并筛选关键基因.结果 3个数据集取交集共获得共计297个共同差异基因,其中184个上调DEGs和113个下调DEGs;筛选出的10个关键基因,均为上调表达基因;KEGG信号通路主要富集于IL-17信号通路、病毒蛋白与细胞因子/受体互作通路以及趋化因子信号通路;GOBP主要富集在趋化因子的生物学过程中.结论 趋化因子及IL-17信号通路可能在银屑病的发生发展中起着重要作用,为其分子机制、诊断和生物学治疗提供指导.

关键词：银屑病、生物信息学、IL-17信号通路、趋化因子

所属期刊栏目：35

分类号：R758.63(皮肤病学与性病学)

资助基金：河南省高等学校重点科研计划项目19A320055

在线出版日期：2023-02-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：1-6