长链非编码RNA-MAL2的靶基因预测及信号通路富集分析

摘要：

目的 运用生物信息学分析方法,分析长链非编码RNA-MAL2(lncRNA-MAL2)在细胞内的调控靶基因及信号通路,并对其进行生物学功能注释,阐述lncRNA-MAL2在细胞内的功能作用.方法 在miRDB数据库和Starbase3.0数据库中预测与lncRNA-MAL2有miRNA-lncRNA互作关系的miRNA,将结果取交集;在Starbase3.0数据库中预测miRNAs靶基因,并进行GO功能注释和Pathway通路富集.结果 在miRDB数据库预测到95个miRNAs与lncRNA-MAL2相作用,Starbase3.0数据库预测到167个miRNAs与之相作用,取2个数据库的交集共获得5个miRNAs;GO功能注释显示其靶基因主要分布在镁离子结合、酶结合、蛋白激酶、蛋白泛素化等方面;生物学过程主要分布在细胞迁移、抑制细胞增殖、凋亡、蛋白转运和细胞周期等功能方面;信号通路富集主要分布在ErbB信号通路、生长激素合成、TNF信号通路、TGF-beta信号通路及雌激素信号通路等方面.结论 lncRNA-MAL2在细胞内的重要调控作用具体与酶结合、蛋白激酶、蛋白泛素化、细胞迁移、抑制细胞增殖、凋亡、蛋白转运和细胞周期等多条信号通路密切相关.

关键词：lncRNA-MAL2、调控靶基因、细胞迁移、蛋白泛素化

所属期刊栏目：35

分类号：Q343.1;Q811.4(遗传学分支学科)

资助基金：南充市科技局项目;南充市科技局项目

在线出版日期：2022-11-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：11-14