长链非编码RNA-Keratin 8的调控通路分析

摘要：

目的 运用生物信息学分析方法,分析长链非编码RNA-细胞角蛋白8(KRT8)在细胞内的调控靶基因及信号通路,并对其进行生物学功能注释,阐述lncRNA-KRT8在细胞内的功能作用.方法 在miRDB数据库和Starbase3.0数据库中预测与lncRNA-KRT8有miRNA-lncRNA互作关系的miRNA,将结果取交集;在Starbase3.0数据库中预测miRNAs靶基因,并进行GO功能注释和Pathway通路富集.结果 在miRDB数据库预测到15个miRNAs与lncRNA-KRT8相作用,Starbase3.0数据库预测到60个miRNAs与之相作用,取2个数据库的交集共获得2个miRNAs;GO功能注释显示lncRNA-KRT8通过hsa-miR-150-5p作用的靶基因主要调控蛋白结合、RNA结合、金属离子结合信号通路、转录调控作用及蛋白质的磷酸化过程;通过hsa-miR-512-3p作用的靶基因主要调控蛋白结合、DNA结合、金属离子的结合信号通路、蛋白质的泛素化降解过程;通过hsa-miR-150-5p主要调控ErbB信号通路、肿瘤中糖蛋白信号通路、miRNAs、胃癌信号通路等;通过hsa-miR-512-3p作用的信号通路主要是乙型肝炎、人T细胞白血病病毒、前列腺癌、胰岛素抵抗和MAPK信号通路等.结论 长链非编码RNA-KRT8在细胞内的调控作用具体与蛋白质的结合和金属离子结合及糖蛋白、脂代谢信号通路密切相关,其可通过上述作用通路调控疾病的病理进展.

关键词：lncRNA-KRT8、肿瘤、靶基因、信号通路

所属期刊栏目：35

分类号：Q343.1;Q811.4(遗传学分支学科)

资助基金：南充市科技局项目;南充市科技局项目;南充市科技局项目

在线出版日期：2022-11-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：6-10