长链非编码RNA-Hexokinase 2的生物信息学分析

摘要：

目的 运用生物信息学分析方法,分析长链非编码RNA-Hexokinase 2(HK2)在细胞内的调控靶基因及信号通路,并对其进行生物学功能注释,阐述lncRNA-HK2在细胞内的功能作用.方法 在miRDB数据库和Starbase3.0数据库中预测与lncRNA-HK2有miRNA-lncRNA互作关系的miRNA,将结果取交集.在Starbase3.0数据库中预测miRNAs靶基因,并进行GO功能注释和Pathway通路富集分析.结果 在miRDB数据库预测到50个miRNAs与lncRNA-HK2相作用,Starbase3.0数据库预测到14个miRNAs与之相作用,取2个数据库的交集得到hsa-miR-374a-5p、hsa-miR-374b-5p 2个miRNAs;GO功能注释显示hsa-miR-374a-5p的靶基因主要调控蛋白磷酸化、肿瘤发生通路、转录调控、DNA损伤反应、脂肪细胞分化及胚胎发育等基因及信号通路;hsa-miR-374b-5p作用的靶基因主要调控基因表达,调控序列特异性DNA结合转录因子的活性、翻译调控、细胞对于胰岛素的反应、细胞粘附及细胞周期等生物学过程,信号通路富集结果主要分布在TNF信号通路、RAS信号通路、人乳头状瘤病毒感染、转录错误调控及多种肿瘤信号通路等方面.结论 长链非编码RNA HK2在细胞内的重要的调控作用,具体与蛋白磷酸化、肿瘤发生通路、转录调控、DNA损伤反应、翻译以及细胞周期等多条信号通路密切相关,其主要通过上述作用通路调控生理和病理进程.

关键词：长链非编码RNA-Hexokinase 2、信号通路、蛋白磷酸化

所属期刊栏目：35

分类号：Q343.1;Q811.4(遗传学分支学科)

资助基金：南充市科技局项目;南充市科技局项目

在线出版日期：2022-11-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：1-5,10