基于生物信息学分析筛选与宫颈癌预后相关的关键基因

摘要：

目的 基于生物信息学筛选与宫颈癌预后相关的关键基因,寻找新的宫颈癌预后的生物标志物.方法 对癌症基因组图谱(TCGA)数据库中的CESC数据集和基因表达总表(GEO)数据库中的GSE39001数据集进行加权基因共表达网络分析(WGCNA),通过构建PPI网络,筛选出与宫颈癌预后相关的关键基因,分析关键基因在宫颈癌中的表达情况、预后和功能作用,并进行验证.结果 共筛选出69个宫颈癌差异基因,这些基因主要参与细胞有丝分裂和细胞周期调控;PPI筛选出10个与宫颈癌相关的关键基因,均表达上调,其中KIF22的高表达与宫颈癌的预后良好相关(P<0.05);构建KIF22生存预测模型,5年生存率的ROC曲线的AUC值为0.612;Western Blot检测宫颈癌组中KIF22的表达,结果显示,与癌旁正常宫颈组织相比,KIF22在宫颈癌组织中表达上调(P<0.05);功能富集结果显示,KIF22高表达与p53通路显著富集.结论 KIF22在宫颈癌组织中高表达,其可能是宫颈癌患者预后良好的关键基因,有可能成为一种潜在的治疗靶点和预后生物标志物.

关键词：宫颈癌、差异基因、生物标记物、细胞周期

所属期刊栏目：35

分类号：R737.33(肿瘤学)

资助基金：教育部重点实验室自主研究基金GKE-ZZ202134

在线出版日期：2022-06-15（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：8-13