10.3969/j.issn.1006-1959.2015.13.002
基于ChIP-seq测序数据的二维快速检索技术
ChIP-seq技术是研究全基因组范围内转录因子结合位点的重要技术。ChIP-seq测序数据晦涩难懂,2009年Simon Anders发明了Hilbert曲线方法,将一维测序数据以二维图像形式呈现。本文在前人工作基础上,研究使用三种图像相似性检索的技术,对测序数据进行快速检索。通过模拟数据测试,证明了图像相似性检索方法在操作性和计算速度方面比传统的序列比对(Blast)检索技术有显著优势。本研究对高通量测序数据的医学诊断或有裨益。
ChIP-seq、Hilbert曲线、图像检索、感知哈希算法、颜色直方图、颜色相关图
R857.3(航空航天医学)
北京市科学技术研究院海外人才专项OTP-2012-011;北京市科学技术研究院创新团队项目IG201305C1。
2015-04-23(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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