基于全长转录组测序的掌叶大黄R1-MYB基因家族鉴定分析

摘要：

作为MYB(v-myb avian myeloblastosis viral oncogene homolog)转录因子家族的一大类,R1-MYB(MYB-related)家族在植物生长发育、环境胁迫及激素信号转导等方面发挥重要的调节作用.本研究基于全长转录组测序分析,系统筛选掌叶大黄R1-MYB家族基因,分析其编码蛋白的理化、结构域及分子进化等特性,利用RNA-seq进行基因组织表达分析,并检测RpMYB24响应激素、非生物胁迫的表达模式.结果表明,共鉴定到掌叶大黄49个R1-MYB家族基因,主要编码热稳定的亲水蛋白,大部分定位于细胞核.各蛋白无规卷曲和α螺旋所占比例较大,存在MYB家族标志性的W型保守氨基酸.掌叶大黄R1-MYB家族成员分布于CCA1(circadian clock associated 1)-like、I-box(GATAAG)-like、CPC(CAPRICE)-like、TRF(telomere repeat binding factor)-like 和 TBP(TATA binding protein)-like5个亚组,且CCA1-like数量居多.RNA-seq揭示49个R1-MYBs基因在掌叶大黄根、根茎及叶中差异表达,根及根茎中分别有15、23个基因表达量高于叶中.发现RpMYB24基因受脱落酸(abscisic acid,ABA)、水杨酸(salicylic acid,SA)和茉莉酸甲酯(methyl jasmonate,MeJA)的诱导,且能显著应答损伤、低温或高温胁迫,但对干旱胁迫响应不显著.本研究系统鉴定了掌叶大黄R1-MYB家族基因及其分子特征,为下一步开展基因功能验证提供基础,进而为大黄药材品质形成的转录调控机制研究提供科学依据.

关键词：掌叶大黄、R1-MYB、转录因子、基因表达、胁迫

所属期刊栏目：58

分类号：R931(生药学（天然药物学）)

资助基金：国家自然科学基金;国家自然科学基金;咸阳市中青年科技创新领军人才项目;陕西省重点产业创新链资助项目;陕西中医药大学秦药品质评价与资源开发学科创新团队项目

在线出版日期：2023-06-14（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：1354-1363