中药火麻仁基原植物大麻MIKC型MADS-box基因家族鉴定与表达分析

摘要：

MIKC型MADS-box基因家族在植物花发育中发挥重要作用.本研究利用生物信息学方法从基因组数据中对大麻(Cannabis sativa L.) MIKC型基因进行鉴定,并对基因序列特征、染色体定位、基因结构、系统发育树和组织表达模式等进行分析.结果 表明,共鉴定出39个CsMADS基因,不均匀分布在9条染色体上,编码的氨基酸数目介于146～503,等电点为5.19～10.12,分子质量为16739.35～57070.56 Da;亚细胞定位预测显示CsMADS基因均定位在细胞核里;保守结构域表明CsMADS基因均含有MADS保守结构域;GO功能注释分类共注释到331个GO terms,主要集中在分子功能中,共聚类178个;系统进化树显示CsMADS基因分为14个亚类,按照ABCDE同源异型基因模型分类,能够分别与拟南芥(Arabidopsis thaliana)中SQUA/AP1、AP3、PI、GGM13、AG、SEP/AGL2等类亚家族聚成一类;CsMADS基因上游启动子区具有丰富的顺式作用元件,其中主要为光调控元件;实时荧光定量PCR验证了部分CsMADS在花和苞片中相对表达量较高,具有组织表达特异性.本研究对大麻基因组中的MIKC型MADS-box家族进行鉴定和分析,为进一步探究MIKC型基因在调控药用植物大麻生长发育以及培育优良品种等方面奠定理论基础.

关键词：大麻;MIKC型MADS-box;全基因组鉴定;功能分析;生物信息学

所属期刊栏目：56

分类号：R931(生药学（天然药物学）)

资助基金：中央级公益性科研院所基本科研业务费专项ZXKT20020

在线出版日期：2021-12-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共11页

页码：3173-3183