药用植物大麻C2H2基因家族鉴定与表达分析

摘要：

C2H2型转录因子在植物生长发育及次生代谢调控中发挥重要作用,本文利用生物信息学从基因组层面鉴定大麻(Cannabis sativa L.) C2H2基因家族成员,基于大麻基因组数据及转录组数据,使用TBtools、MEGA软件以及NCBI、PlantTFDB、ExPASy、HMMSCAN、MEME、WoLFPSORT、PlantCARE等在线网站对其基因信息、染色体定位、进化关系、保守基序、共线性关系等进行分析.结果 显示,大麻中含有30个C2H2型基因家族成员(CsC2H2-1～CsC2H2-30),分布在大麻的9条染色体上,氨基酸大小介于138～635个氨基酸,理论等电点介于5.85～9.52,蛋白质分子质量介于15909.48～68445.53 Da.转录组结果分析显示,CsC2H2在大麻Diku品种的雌花、苞片、叶、茎及不同品种雌花中表达量均存在差异.实时荧光定量PCR结果验证了CsC2H2-1、CsC2H2-5、CsC2H2-19在Diku品种的雌花及苞片中表达显著,为深入研究C2H2基因家族功能及大麻优质品种的选育提供理论参考.

关键词：大麻、C2H2基因家族、生物信息学、系统进化、功能预测

所属期刊栏目：56

分类号：R931(生药学（天然药物学）)

资助基金：中央级公益性科研院所基本科研业务费专项;国家中医药管理局全国中药资源普查项目

在线出版日期：2021-06-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共11页

页码：1486-1496