利用转录组测序挖掘掌叶大黄蒽醌类生物合成相关基因

摘要：

蒽醌为中药大黄的主要活性成分,也是大黄质量控制的指标成分.为研究大黄蒽醌类生物合成通路,用Illumina HiSeqTM 2000 150PE对掌叶大黄幼苗转录组文库进行高通量测序,得到11.04 G数据,736 309 74条高质量reads (SRA数据库注册号SRP160030).Trinity do novo组装产生93 646个unigenes,平均长度l 108 nt.功能注释表明所有unigenes在NR、NT、Swiss-port、PFAM、KOG等数据库得到注释,可归为GO分类的生物过程、细胞组分和分子功能3大类57分支,KEGG分析发现1107条unigenes参与19个次生代谢标准通路.172条unigenes编码蒽醌类生物合成相关的MVA、MEP、莽草酸及聚酮途径28个关键酶.125条CYP450基因可能参与次生代谢物的修饰,73条与糖基转移酶相关.RT-PCR和测序成功验证7个蒽醌及黄酮类候选全长unigenes.MISA还发现18 885个SSRs.该研究首次获得掌叶大黄幼苗转录组基因表达特征及蒽醌类生物合成通路基因,为后续基因功能鉴定、次生代谢途径解析及蒽醌类生物合成与调控分子机制研究提供基础资料.

关键词：掌叶大黄、转录组、蒽醌、基因、代谢通路

所属期刊栏目：53

分类号：R931(生药学（天然药物学）)

资助基金：陕西省高校青年杰出人才支持计划项目;江苏省自然科学基金;领军人才项目;陕西中医药大学新进博士科研启动经费

在线出版日期：2018-12-14（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：1908-1917