日本蟾蜍TAGLN2 cDNA的克隆与生物信息学分析

摘要：

为研究蟾蜍皮肤中多肽类有效成分,通过菌落PCR (polymerase chain reaction)对日本蟾蜍(Bufojaponicus formosus)皮肤cDNA质粒文库进行筛选,对测序结果进行分析及同源性比较,获得转胶蛋白-2(transgelin-2,TAGLN2)的5'端缺失的部分cDNA序列(GenBank登录号为JX197456),长为997bp,包括348 bp的开放阅读框(open reading frame,ORF)、5’端31 bp及3’端618bp的非翻译区(untranslated region,UTR),编码由115个氨基酸残基组成的蛋白质.推导的氨基酸序列含有一个调宁蛋白同源性结构域(calponin homology,CH)、两个可形成二硫键的半胱氨酸残基、3个α螺旋区域和5个潜在的磷酸化位点.氨基酸序列同源性分析显示,本文获得的日本蟾蜍N-端截短型TAGLN2与热带爪蟾(Xenopus (Silurana) tropicalis)和非洲爪蟾(Xenopus laevis)相对应部分的同源性分别为90％和89％,与其他7种动物的同源性介于71％～85％之间.

关键词：日本蟾蜍、转胶蛋白-2、基因克隆、生物信息学分析

所属期刊栏目：48

分类号：R931(生药学（天然药物学）)

资助基金：国家自然科学基金资助项目31071181;2011年度浙江省科技创新活动计划项目2011R412042

在线出版日期：2013-03-21（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：250-254