西洋参PqERF1基因的克隆和生物信息学分析

摘要：

乙烯响应因子(ethylene responsefactor,ERF)是具有PETALA2(AP2)结构域的转录因子.本研究通过西洋参(Panax quinquefolius L)的转录组高通量测序结果分析获得75条具有AP2结构域的转录因子序列,并克隆到一条开放阅读框为933对碱基的基因序列,定名为PqERF1.基因表达分析结果表明PqERFl基因受茉莉酸甲酯(MeJA)的诱导,这与人参皂苷含量的受诱导模式相同.蛋白结构预测结果表明PqERF1是定位于细胞核的具有完整保守的AP2结构域的转录因子,InterproScan蛋白功能结构域分析结果表明PqERFl很可能为发病机制相关蛋白;序列比对和进化关系分析结果也显示PqERFl与发病机制相关蛋白(烟草NtERF4)、次生代谢产物相关合成蛋白(野胡萝卜DcERFl)和花衰老相关蛋白(矮牵牛PhERFl2)的相似性高,且系统进化关系较近.因此,推测PqERFl基因可能是参与西洋参次生代谢产物合成调节、抗病性和衰老相关的重要基因.

关键词：西洋参、乙烯响应因子、实时荧光定量PCR、次生代谢、植物防御

所属期刊栏目：46

分类号：R931(生药学（天然药物学）)

资助基金：国家自然科学基金30873459

在线出版日期：2011-12-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：1008-1014