长非编码RNA LOC285194在宫颈癌中的表达及相关ceRNA网络的探究

摘要：

目的:利用多中心样本探究长非编码RNA LOC285194 在宫颈癌组织中的表达水平及相关内源竞争RNA网络.方法:收集来自GEO、TCGA、ArrayExpress、SRA等数据库中与宫颈癌相关的高通量数据集,利用散点图和独立样本t检验探究各个数据集中LOC285194 在宫颈癌组织与非癌宫颈组织对照中的表达差异.同时,合并计算标准化均数差(SMD)以综合评估LOC285194 在宫颈癌组织中的表达水平.DIANA-LncBase v3 和TargetScan Human v8.0 数据库用于预测与LOC285194 有靶向关系的miRNA以及相关的mRNA,ENCORI数据库用于计算miRNA与相应靶基因表达的相关性.结果:通过综合计算618 例样本(CC样本399 例,正常宫颈样本 219 例)的SMD,结果提示LOC285194 在宫颈癌组织中的表达水平显著低于正常对照组织(SMD =-0.43,95%CI-0.61～-0.25,P＜0.05).结合预测以及综合计算SMD,3 个与LOC285194 相关的miRNA被纳入:hsa-miR-130b-5p、hsa-miR-141-5p和hsa-miR-200a-5p.同时,通过综合计算,hsa-miR-141-5p 在宫颈癌组织中的高表达及其靶基因 ZNF385D 的低表达得到了验证.结论:LOC285194 在宫颈癌组织中呈显著的低表达,其可能通过相关的内源竞争RNA机制参与宫颈癌的发生与发展,值得进一步的研究探讨.

关键词：宫颈癌、长非编码RNA、LOC285194、内源竞争RNA

所属期刊栏目：36

分类号：R737.33;R36(肿瘤学)

资助基金：广西壮族自治区卫生健康委员会科研课题Z2016658

在线出版日期：2023-08-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：2356-2360,2367