2019-2020年西宁地区丙型肝炎病毒感染者基因序列分析

摘要：

目的 了解2019-2020年西宁地区丙型肝炎病毒(hepatitis C virus,HCV)感染者HCV感染株基因型.方法 采集2019-2020年青海省疾病预防控制中心门诊HCV感染者抗体阳性血清108份,采用实时荧光定量PCR法(RT-PCR)进行HCV-RNA阳性筛查,对HCV-RNA阳性标本进行RT-PCR特异性引物扩增后用直接测序法进行HCV基因片段的测序.结果 108份HCV抗体阳性血清标本中共检测到77份阳性血清,经过RT-PCR扩增,共检出54份阳性标本,测序后得到25份核苷酸片段,再经序列测序进化分析得到2a型17份,占总数的68％;1b型8份,占总数的32％.2a型分布于两个不同的分支上,其中一个分支与ZX 2005-197株(KP 721897.1)在同一分支上,此柱为有明显输血史感染柱,另一分支与广州GZ 0160(206047)和KM 26(KF 586099)WL 14(KF 586224.1)的自愿献血者感染株为同一分支;8份1b型分布于3个不同的分支,其中一组与上海的标准株PR 50(HQ 912957.1)在同一分支上,另一组与美国的毒株KY 565218.1亲源关系较近,其余的序列单独形成一个分支.结论 西宁地区HCV感染基因型以2a型为主,其次为1b型,此次检测结果与西宁地区其他关于HCV感染主要基因型研究报道有所不同.

关键词：西宁地区、丙型肝炎病毒、RNA、实时荧光定量PCR、基因测序、分析

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分类号：R512.6+3(传染病)

资助基金：青海省传染性疾病分子生物学重点实验室项目2021-0402-ZJC-0021

在线出版日期：2022-06-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：598-600,603