人易感H10N8禽流感病毒血凝素蛋白主要特性及B/T细胞抗原表位预测分析

摘要：

目的 应用生物信息学方法分析人H10N8禽流感病毒血凝素蛋白(hemagglutinin,HA)的主要特性,预测可能的B/T细胞抗原表位.方法 采用ProtParam预测H10N8禽流感病毒HA蛋白的理化特性,SOPMA预测二级结构,Motif Scan预测翻译后修饰位点,DNAStar分析其序列的亲水性指数、柔韧性指数、可及性参数以及抗原指数,推测B细胞抗原表位的可能位置,并采用SYFPEITHI的T细胞表位预测工具分别预测CTL和Th细胞表位.结果 人易感H10N8禽流感病毒HA为亲水性蛋白,二级结构中包含218个α-螺旋、108个β-片层、64个β-转角和171个无规卷曲,具有多个糖基化、酰胺化及磷酸化翻译后修饰位点.经综合各种参数,预测出H10N8禽流感病毒HA蛋白可能存在的7个B细胞抗原表位、7个CTL细胞表位和8个Th细胞表位.结论 HA蛋白B/T细胞抗原表位的预测为人易感H10N8染禽流感病毒的疫苗研制奠定了一定的基础.

关键词：人、H10N8、血凝素蛋白(HA)、B/T细胞表位、生物信息学

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分类号：R373.1+3(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：国家“十二五”科技重大专项2012zx10004-208;青海省卫生计生委重点课题2017-wjzd-08

在线出版日期：2018-05-24（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：311-314