佛山市南海区2012-2014年1型登革病毒基因特征研究

摘要：

目的 测定佛山市南海区2012-2014年登革病毒1型(DENV 1)的E基因序列,探讨其来源及基因特征.方法 收集佛山市南海区2012-2014年本地登革热疑似病例急性期血清标本进行登革病毒核酸及分型检测,用RT-PCR法扩增1型登革病毒的全长E基因,经测序后获得E基因序列,并绘制进化系统发育树进行分子流行病学分析.结果 554份病例标本中检出279份DENV核酸阳性,其中DENV 1 271份(97.1％),DENV 2 8份(2.9％),测序获得15株DENV 1 E基因序列,DENV 1碱基同源性为90.3％～99.9％,推导氨基酸同源性为97.2％～100.0％,其同源性与1998、2004、2006、2010和2013年国内DENV 1流行株接近.进化分析发现DENV 1可归属于两个亚型,亚洲型和美洲/非洲型.结论 佛山市南海区2012-2014年以DENV 1型流行为主,其存在两种基因亚型流行,登革病毒与周边相邻地区如佛山及广州市的登革病毒存在明显关联性,具有地方性登革热流行趋势.

关键词：登革病毒、E基因、测序、系统发育

所属期刊栏目：31

分类号：R373.3+3(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：佛山市卫生局医学科研项目2014360

在线出版日期：2015-09-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：852-856