栀子及其近缘茜草科植物、混伪品的rDNA-ITS2序列分析

摘要：

目的:利用rDNA-内转录间隔区2(internal transcribed spacer 2,ITS2)序列对栀子及其近缘茜草科植物、混伪品进行快速鉴定.方法:对研究材料ITS2片段进行聚合酶链式反应(PCR)扩增并双向测序,所得序列经CodonCode Aligner拼接后,序列变异位点采用PAUP 4.0b10进行统计分析,利用MEGA 5.0软件进行数据分析,并构建邻接(NJ)树,再利用已建立的ITS2数据库及其网站预测ITS2二级结构.结果:对栀子及其近缘茜草科植物、混伪品ITS2序列长度为201～235 bp,系统发育树上显示不同来源的样本根据亲缘关系的远近各聚一支,表现出单系性;而同时又与混伪品明显分开.比较ITS2二级结构发现,栀子及其近缘茜草科植物、混伪品在4个螺旋区的茎环数目、大小、位置以及螺旋发出时的角度均有明显差异.结论:rDNA-ITS2可以方便快捷地鉴定栀子及其近缘茜草科植物、混伪品.

关键词：栀子、茜草科、rDNA-ITS2、DNA内转录间隔区、药材DNA鉴定、二级结构、植物分子鉴定、基因检测

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分类号：R917(药物基础科学)

资助基金：四川省科技厅-泸州市政府-泸州医学院三方联合专项;四川省科技支撑计划;泸州市政府-泸州医学院联合专项;四川省教育厅重点科研项目;四川省科技支撑计划

在线出版日期：2015-11-25（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：1709-1715