2个产地红景天rDNA-ITS序列及亲缘关系分析

摘要：

目的:对我国2个主产区的主要红景天(RhodiolaL.)品种rDNA-内转录间隔区(ITS)序列进行分析,为红景天种质资源的分子鉴别及进化关系提供依据.方法:提取核基因组DNA,聚合酶链反应(PCR)克隆ITS序列;经DNAstar软件拼接序列后,通过Clustal X软件进行比对,考察其变异位点及信息位点;用Mega 4.1计算品种之间的遗传距离,构建最大简约树(maxi-mum parsimony,MP)和邻接树(neighbor-joining,NJ).结果:5种红景天材料rDNA-ITS序列长度为603 ～ 604 bp,ITS1、5.8SrDNA和ITS2的DNA长度分别为226 bp、164 bp和213 ～214 bp.ITS1和ITS2分别含有11和9个变异位点,其中,信息位点分别为6和2个;存在转换、颠换、缺失等现象;5.8 S rDNA序列含7个变异位点,2个信息位点;试验中红景天品种的遗传距离为0.018 2～0.627 3.大花红景天与柴胡红景天亲缘关系最近.结论:rDNA-ITS序列是鉴别红景天品种,研究遗传关系的良好方法.

关键词：红景天、转录间隔区、分子鉴别、进化关系、基因组、DNA、聚合酶链反应

所属期刊栏目：35

分类号：R917(药物基础科学)

资助基金：国家自然科学基金;山西省自然科学基金;高等学校博士学科点专项科研基金

在线出版日期：2015-11-25（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：1704-1708