豚鹿SSR标记开发与遗传多样性分析

摘要：

以上海动物园圈养豚鹿(Axis porcinus)日常体检中抽取的血液为试验样品提取总DNA,利用高通量测序技术对通过探针富集得到的SSR序列测序,并用MISA检索SSR标记.结果表明:单碱基重复SSR到六碱基重复SSR在豚鹿基因组中均有分布,其中双碱基重复占比最高,在双碱基重复中以AC/GT重复为主.本研究成功开发出7个SSR标记,这些标记在22只豚鹿个体中检测到等位基因2～5个,在豚鹿种群中的平均多态信息含量(PIC)为0.421,平均期望杂合度(He)为0.513.7个SSR标记中有3个高度多态标记、3个中度多态标记和1个低度多态标记,可用于豚鹿的遗传多样性研究.

关键词：豚鹿、微卫星、分子标记开发、遗传多样性

所属期刊栏目：43

分类号：Q953(动物学)

资助基金：北京动物园圈养野生动物技术北京市重点实验室开放课题项目;上海动物园园级课题项目

在线出版日期：2022-08-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：816-820