基于粪便DNA技术的鸟类物种鉴定体系研究

摘要：

利用粪便DNA技术对候鸟进行物种鉴定,对了解鸟类在繁殖地和越冬地的种类分布、研究其迁徙路线等具有重要意义.本研究扩增、测定了76份雁形目鸟类粪便的D-loop区序列,将其与NCBI数据库中已知鸟类同源序列进行比对分析(BLAST比对法).结果表明:相似度为98.07％ —100％,其中75％的单倍型可以被认定为单一物种,25％的单倍型检测为非单一物种,即包含2个近缘物种.比较基于Ts、Ts+Tv碱基替换计算的K2P遗传距离,说明后者更适合于D-loop区序列特征.而且,以此为基础的遗传距离法、ABGD划分法和系统发育树法可以得出一致的物种鉴定结果,消除了BLAST比对法时出现的非单一物种.由此构建了一套方法齐全、标准明确的鸟类粪便物种鉴定体系.该体系使得鸟类物种鉴定流程更具系统性、规范性,得出可信的鉴定结论,可以推广应用于其他检材的物种鉴定领域.

关键词：雁形目鸟类、粪便DNA分析、物种鉴定、控制区、序列分析

所属期刊栏目：41

分类号：Q953(动物学)

资助基金：国家重点研发计划项目;中央高校基本科研业务费专项资金项目;大学生创新创业训练计划项目

在线出版日期：2020-03-21（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：145-151