利用Illumina MiSeq测序平台分析健康与腹泻食蟹猴粪样菌群

摘要：

本试验通过对比健康与腹泻食蟹猴粪便菌群的差异,初步探讨腹泻对食蟹猴粪便菌群的影响.采集成年腹泻与健康食蟹猴粪样各6份,用细菌16 Sr DNA通用引物扩增V3—V4区,采用Illumina MiSeq测序平台对食蟹猴粪便微生物进行研究.结果表明,Alpha多样性指数分析,健康组与腹泻组的微生物多样性指数(Shannon、Simpson)差异不显著,群落丰富度指数(Chao、Ace)差异显著.PCA主成分分析,健康组与腹泻组粪便菌群具有明显的差异.通过对健康组与腹泻组物种菌群组成分析,运用MetaStat方法分析,与健康组相比,腹泻组的芽孢杆菌纲、 乳酸杆菌目、 乳酸杆菌属含量显著降低(P<0.05),腹泻组Subdoligranulum属显著升高(P<0.05).LEfSe(LDA Effect Size)分析(LDA阈值为1),乳杆菌目,芽孢杆菌纲,乳杆菌科,乳酸杆菌属在健康组中显著富集,弯曲杆菌科,弯曲杆菌属在腹泻组显著富集.与健康食蟹猴相比,腹泻食蟹猴微生物区系中的一些菌群发生变化,菌群结构有差异但不显著(P>0.05),腹泻食蟹猴菌群结构有简单化的趋势.

关键词：食蟹猴、肠道菌群、腹泻

所属期刊栏目：40

分类号：Q95-33(动物学)

在线出版日期：2019-08-02（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：595-601